黄台吉和阿济格两路大军都被击退，接下来几天明军都在镇江城一带修整过冬，得到消息的朝鲜君臣听闻明军大胜，欣喜若狂。之前听到军情说黄台吉亲率数万大军来袭，朝鲜上下都以为丙子胡乱将会再现，国王和大臣都已经准备再一次逃跑了，却没想到数量居于劣势的明军居然一举击败了东虏，累计斩首听说都快过万了，朝鲜安全了，再也不会遭受胡人的杀掠了。
朝鲜国王李倧欣喜之下赶紧派遣领议政金鎏带着大批的酒、肉、粮食、草药以及银两前来镇江城犒军，之后听闻督师刘重元积劳成疾又感染风寒病的不轻，随即又让吏曹判书（相当于大明的吏部尚书）崔鸣吉搜罗了朝鲜十数名医官，其中还包括三名朝鲜王宫内的医官。朝鲜上下都已经将刘重元当成了救世主，抵挡东虏再犯朝鲜的柱石栋梁。
而且与过往本事不大脾气不小的边帅边将不同，刘重元那可真是史书上写的君子之风。过往与朝鲜打交道的大明边帅边将，远的如抗倭援朝时期的杨镐、李如松，近的如东江镇毛文龙、沈世魁，一个个的贪婪无度，总是向朝鲜上下索要钱财珠宝还有美女，搞得朝鲜上下不胜其扰，而且对朝鲜总是一副高高在上趾高气昂的架势。
而刘重元则完全不同，谈诗文时儒雅有加如沐春风，谈论军政时侃侃而谈有理有度，从来都是以理服人以德服人，让人大生好感。至于私德方面，别说是索要钱财了，就连主动赠送的钱财珠宝也只是收取了一些朝鲜特产而已，其他都一一退回，说是朝鲜刚刚经历丙子胡乱，满目疮痍，现在又要整军兴武对抗东虏，财政定然紧张，就不要在多加破费了。如此做派，如何不让朝鲜上下倾慕有加、赞叹不已。
在病榻上，刘重元命令金州镇和督标营暂且在镇江城一带修整并过冬，待天气稍稍好转之后两军恢复元气之后，命令以黄得功作为提督，相机夺取凤凰城，命令尤世禄率金州镇沿岫岩，同时传令在金州的尤世威指挥山东镇和东江镇，相机进攻盖州，趁着东虏刚刚大败士气低落之时，将北洋原本所占据的金州、复州和镇江城这三个点，通过线连称一片，彻底占据整个辽南。
茅元仪代刘重元向朝廷报捷，自九月初六到十一月，历时两个月的镇江城战役中，督师刘重元亲率北洋九营陆军，攻占镇江城，击败黄台吉、阿济格率领的反攻大军，阵斩东虏固山额真伊尔登、梅勒额真伊尔德以下五千七百六十人，取得自巨鹿之战、金州之战、锦州之战之后又一次巨大的胜利，极大地挫伤了东虏的士气。
当然在巨大的胜利背后，北洋军也遭遇了巨大的损失，尤其是金州镇几乎是被打断了脊梁骨，右营和后营几乎是被打残废了，只能两营合成一个营都不能满编，左营和中营也都是损失过半，尚需时日才能恢复元气。如此大败，若非是紧接着经历了对黄台吉和阿济格的大胜，金州镇非得解散重编不可，即便是如此重新招募新兵、恢复士气、养好伤员、训练成军都需要至少半年以上。好在经过了这番先败后胜的血战，金州镇上下也算是经受住了战场的磨练，想必假以时日定然会成长为一支铁军。
东江镇总兵李国英率领前营叛变投降东虏，这一严重失败，即便是这次巨大的胜利也无法掩盖，在奏章里，刘重元也老老实实的向朝廷请罪，检讨自己用人失察、督责不力，没有发现李国英这个狼心狗肺的巨奸。
而且更让刘重元头疼的是，李国英在东江镇内关系深厚，与金声桓、卢光祖两人交情莫逆，如果李国英继续勾引两人，会不会引发连锁反应？好在此次大胜东虏，北洋军上下士气高涨，金卢两人应该不会做此傻事。
除了刘重元的奏章，还有金州镇总兵官尤世禄的请罪奏折，当日指挥金州镇和东江前营抵御黄台吉大军的是他，第一责任人当然也是他，李国英率部投降虽然更多地是其不忠叛国，但是尤世禄指挥失误也是一大原因。
刘重元也在奏折中，提及了尤世禄的指挥失误，按照大明律令以及过往的案例，尤世禄即便不是下狱充军，至少也得罢黜总兵之职削职为民返乡居住。奏折中刘重元为其求情，看在尤家为大明出生入死的面子上，请求从轻发落，降总兵为副将戴罪立功。
如此一来，北洋军就得大规模的重整。刘重元又给杨嗣昌写信，建议北洋军仍然维持三镇一督标营的编制，建议将将督标营中营整体调入金州镇，黄得功调入金州镇接任总兵官之职，一来是论功行赏，金州镇总兵官乃是朝廷正印的一镇总兵，正好奖励此战督标营此战发挥的巨大作用；二来也是希望能够将火枪阵战术从督标营传播到整个金州镇，进一步提升北洋军的整体实力。金州镇前营罗岱所部一直在复州一带归尤世威指挥，那里地势相对更加平坦，也更需要骑兵作战，因此刘重元提出从金州的卫所兵中选拔官兵组成一个新的营头加入金州镇，作为新的前营，提拔此战有功的督标营军官李牟为副将衔坐营官。
至于督标营总兵官，暂时空着由自己直接指挥，常务工作由赵石处理。而随着方以智率领前营远征台湾，黄得功带着中营去了金州镇，刘重元希望督标营能够在增编一个营，再加