朱由桦恢复了北方，所面临的第一个问题是什么呢？说来大伙儿肯定也都知道，甚至应该也能明白。
整个帝国的南方，开始爆发大规模的农民起义！
其规模之大，令人惊恐，乃至于听闻消息的朱由桦都感觉将要行至末世。本身朱由桦就不是什么好东西，没错，他确实省宫室，罢音乐，不选秀，但是这厮要打仗啊。不是打一天，是打十年二十年，穷尽民力去赡养士兵。
在京师恢复之后，朱由桦不可避免的要重新恢复九边的防御，迁移军队，充实户口，增修寨堡。同时也是最重要的，大兴工役，疏通运河，同时恢复沿运各处的军事要隘和防御体系，并保证漕运的畅通。
不错，朱由桦也确实施行了海运，但是海运的运力，在短时间之内，是始终无法和内河漕运相比较的。海船的要求比一次性的内河漕船要求高太多，而且去辽东确实是海运方便，去京师就要差那么一截。
海运可以从营口、牛庄一路直驱辽阳，趁着辽河涨水，上百吨的大船都能够靠岸，可是京师呢？海运到天津卫，然后下来换船换人，这个效费比也就那样了。
另外还有一个现实的问题，在蒸汽火轮船没有发明之前，风帆动力的船只受到东亚季风的影响，每年有半年是没有办法北航的，而这半年恰好又是漕运封冻的冬季。合着你也没有办法补充冬季漕运的缺失，必要性自然也大大下降。
所以不可避免的，朱由桦要快速对北方补血，就需要整备运河，大兴海运，双管齐下。海船要造，先往辽东转运。运河要修，维护燕山防线。
于是大起江南工役，征调民夫四十余万，疏浚扬州至徐州段的黄河。又自山东和河南征调十余万众，开始整备北方的运河。
没有经历过大规模整顿的官僚队伍，虽然因为朱由桦相对严厉的反腐态度，以及连续增加的养廉银子，有所收敛。这是这样大规模规的工役，盯上的人太多了。都觉得我只是小小的伸一次手，无伤大雅，到最后会是什么结果？
在淮安转送往徐州的十余万民夫不堪压迫，愤而起义，城内外，淮水南北群起呼应，淮安城不攻自破。城内原本的江北经略标营因为北方的收复已经调往山东，城内又没有坐镇的淮扬巡抚大臣，主持运河疏浚的官吏大多在扬州这个水网密集的地方。
得到了淮安的大量粮草和向北转运的军资，起义军很快成事。加上被行伍约束，有了一定的纪律基础，编队的劳役又磨练了他们坚定的意志。
一路乘船南下，准备打破扬州，一路招募沿途民夫加入，势力很快膨胀到三十余万。而南方的精兵此刻都在北面，整个南京也只有两万多水师驻防。朱由桦还在京师坐镇，实际主持南京朝廷的是何腾蛟。
他才不会调遣御营中军出京作战！
扬州毫无疑问的被愤怒的二十余万起义军攻克，扬州同样安置了大量的粮草和军械，这一回同样全部武装了起义军。
只不过这会子起义军内部发生了分歧，军中的大部分人是自江南、浙北、江西等地征集而来，所以大部分人的想法是打回老家去，破了南京，让朱三这个狗皇帝在他的北方快活吧。
但是也有明智的人觉得应该趁着南京朝廷和北方大军的联系被割裂，快速的夺取整个淮河沿线，建立防线，以预备可能会飞速南下救援南京的朱由桦。
反正北方乏粮，朱由桦几十万大军加民夫，还有几十万骡马，只要没得吃，三天五天就要崩溃。等朱由桦的人马崩溃了，再挥师南下，到时候事半功倍。
可惜这一良策没有得到大多数人的支持，大多数人还是因为不堪压迫而起义，没有什么太大的目标，只想回家过日子而已。要怪只怪朱由桦压迫太狠，贪官污吏又多，工程催的还急切，总之就是朱三不是个东西，他手底下也都不是东西。
于是起义军主力三十余万乘坐舟船南下，一路席卷江南和浙北各郡，所到之处大加杀掠，所谓“内库烧为锦绣灰，天街踏尽公卿骨”。起义军短时间内就将武备松弛的苏、松、常、嘉、湖等府全部攻陷，满城士绅一概杀绝。
名门大户，但凡有功名者，只是杀杀杀杀杀杀杀！
尤其是征募民夫北上疏浚运河之士绅，家中老幼，一个不留。整个江南浙北几乎所有的士绅集团，为之夷灭。
而后出身浙北的起义军分兵十万攻打杭州，而出身江南和江西的起义军则动兵三十余万围攻南京。城内官绅，颤栗非常，恐惧万分，还好何腾蛟虽然不救扬州，却愿意死守南京。
他毫不犹豫的借用监国太子朱慈焞的名义，搜括城内大户，然后打开太仓和内帑，出白银二百万招募城内壮勇登城以竹竿捅刺蚁附登城的起义军，双方很快陷入僵持。
此时此刻身在北方的朱由桦终于等到了江南江北大起义的消息，立刻带兵南下。留守在淮水沿线的起义军虽然也集合了部分起义势力，但是终究无法顶住朱由桦那十多万要回援南京，救护自己家眷的御营兵。
顿兵于南京城下的起义军最终受到两面夹击，人马死者不计其数，长江为之赤红，少说亦有二十余万。
加上起义军所杀掠的数十万官绅家口，整个江南的士民，在短短数月之内，亡死一百万以上！
名城大郡为之一空！
而后各种起义此起彼伏，连月不休，等朱由桦镇压了浙北的十余万起义军之后，浙北人口亦损失超过一百万，名儒士绅被杀殆尽。
北方没了人马屯守，又得不到朱由桦的救助，高呼一声“死国可乎！”，接连起兵。你朱三没法给我们饱饭吃，那我们就要起来干死你这个朱三，你朱三照样是猪狗不如的畜生。
何谈百废待兴，唯有百废而已……