女的名义，被乾隆封为“还珠格格”并准备在祭天大典时，召告天下世人。紫薇于祭天大典时发觉小燕子竟成了格格，这使她惊讶不已，直觉认定小燕子背叛了自己，因而在街上情绪失控的大吼，却换来了官兵们的一阵毒打。
尔康发觉事有蹊跷，将紫薇带回家中疗养，加上紫薇对于夏雨荷之事的详尽叙述，使得众人对於小燕子的身份，开始起了怀疑。
第5集小燕子为求能见紫薇一面，居然将自己化妆成了小太监，并打算趁深夜里偷溜出宫，但皇宫禁备深严，岂会让她如此轻易地就离开。乾隆得知此事后，虽然原谅了小燕子，却也坚定了乾隆要好好教导小燕子礼数的决心。
紫薇得知了小燕子伪装出宫欲见自已之事而感动不已。在尔康及尔泰的建议下，众人决议将事实告知永琪，透过永琪的里应外合，尽快让紫薇及小燕子见面，好让事情及早水落石出。
小燕子在永琪和尔泰的面前，竟然没推托的便将事实全招了，而当她得知紫薇如今在福家之时，更是雀跃不已，不分由说的就要立即去见紫薇。
永琪适时向小燕子分析了事情的严重性，小燕子这才知道自己犯下了欺君大罪。此时，正巧皇后来探，小燕子不慎冒犯皇后，而被容嬷嬷打了一耳光。永琪见情势危急，急忙请出了乾隆。
第6集小燕子和皇后间的风波在乾隆的出面後终告平息，但皇后对小燕子的敌意却是更加的浓厚了。小燕子漏夜写了封信托永琪带给紫薇，原来大字不识几个的小燕子托人带来的是画不是信，正当众人猜不透小燕子画中之意时，紫薇竟将小燕子的画用诗表达出来，令众人对紫薇的才情佩服不已，尤其是尔康。
紫薇从画中得知小燕子乃是身受重伤才得以入宫，又知道乾隆仍未忘了自己的母亲。在深思之下，紫薇决定放弃认亲之事，将此秘密永藏心中。正当紫薇打算离开的同时，尔康为留住紫薇，忍不住地向紫薇告白了，尔康此举令紫薇震慑不已，居然点头答应留下，也不再掩藏彼此之间早已滋长的情愫。
乾隆为调教小燕子，命令小燕子和众阿哥等人一同上课，幸得永琪和尔泰的帮忙，才让小燕子安然渡过此难关，也为平静的课堂带来了笑声及活力。
不料，皇后此时却降低姿态向乾隆示好，终於由乾隆口中取得了教养小燕子的权力。
第7集乾隆终于听了皇后的话，让容嬷嬷教起小燕子规榘来。小燕子见这回推也推不掉，只得心甘情愿地学起了规榘。但不知是小燕子真没有学规榘的天份，又或者是容嬷嬷的蓄意刁难，小燕子就是做不到容嬷嬷要求的标准。小燕子一气之下，气急败坏地就想逃开。适巧此时乾隆来探，见到小燕子此状大为光火，而小燕子又不懂得看脸色，竟还火上加油的顶撞了乾隆几句，乾隆在震怒之下，决定重打小燕子二十大板，幸而後来永琪及令妃等人的求情，乾隆才下令停止，但此时小燕子早已被打成重伤了，却还心有凄凄地挂念着紫薇。
紫薇得知小燕子受伤，不分由说地便想入宫去看她，也让众人更加地了解两个女孩间的深厚情谊。
小燕子被乾隆重罚後害怕不已，乾隆不忍，又思起当年和夏雨荷间的种种，终於原谅了小燕子，并下令小燕子以後拥有豁免权，可以不必遵受宫中的繁文缛节。
紫薇得知此事也雀跃不已，并在好心情的情况下，向尔康提出了回大杂院看看的要求。
第8集紫薇和尔康回到了大杂院，尔康见到紫薇和柳青间的谈话，竟有了醋意，便下定了决心，向紫薇倾诉了此生不变的情谊，以及两人之间所需面对的重重困难。紫薇惊讶，不敢也不愿承受这一切，使得两人之间的恋情，面临了严重的考验。
紫薇回送了画给小燕子，说明了自己准备放弃认亲的打算，小燕子惶恐，不愿抢了紫薇应有的一切，便立刻要求和紫薇当面说清楚。永琪和尔泰拗不过小燕子，便计划好趁着深夜，将宫女假扮成小燕子躺在床上，再由永琪带着改装成小太监的小燕子出宫。
紫薇和小燕子终于见面了，两人相见不胜唏嘘，紫薇担心着小燕子的伤势，而小燕子则满心懊悔。惟有金琐，虽对小燕子无法原谅，却又细心照料着小燕子的伤势，令小燕子感动不已。不料，在这同时，漱芳斋内却突然地灯火通明，原来是乾隆和令妃突然来访。
第9集乾隆和令妃突然至漱芳斋欲探小燕子，不料却发现了小燕子私溜出宫之事，令乾隆为之气结